Po zničení armády Locustov sa na Sere začína obnova ľudskej civilizácie, no piráti a nová, desivá hrozba ohrozujú posledné ľudské útočisko. Marcus Fenix a ostatní gearovia musia spojiť sily s odpadlíkmi a čeliť nepriateľovi, ktorý desí aj samotných Locustov.